covaris特色产品介绍: AFA-TUBE ®超声管

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AFA-TUBE 是一款专门设计的聚合物容器,设计用于使用 truSHEAR 对样品体积范围为 10 至 20 µl 的 DNA 进行剪切。它提供板和条带,可用于提高 NGS 工作流程中自动化平台的周转时间和吞吐量。这种新格式可以与加热块、磁铁和热循环仪兼容。板和条带均包含用于样品跟踪的 RFID,专门与 Covaris 仪器一起使用。

96 AFA-TUBE TPX 板

Covaris 工程聚合物板可处理 8 至 96 个样品,体积范围为 10 至 50 µl。启用 RFID 样本跟踪。

8 AFA-TUBE TPX 条

Covaris 工程聚合物条可处理多达 8 个样品,体积范围为 10 至 50 µl。启用 RFID 样本跟踪。

AFA-TUBE 的特点和优点

特征 益处
单个容器中的多个过程(例如剪切、非接触式混合、裂解) 工作流程简化
用于等温控制的工程聚合物 无热致偏差或样品损坏
基于 RFID 的样品板跟踪 样品监管链和多板、批量处理
使用 AFA-energetics® 实现均匀分布的空化 处理速度更快
标准实验室器具 SBS 板格式设计 与大多数液体处理机兼容
无纤维激光蚀刻塑料 易于自动化

AFA-TUBE NGS 工作流程

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使用 AFA-TUBE 获得高精度且可重复的结果

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图 2:LE220-Plus,样品体积为 10 µl。结果显示,96 AFA-TUBE TPX 板的预期目标尺寸为 150 和 350 bp,每个重复 24 个,尺寸分布紧密。

从全血中提取 HMW gDNA

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图 3 :使用高分子量 (>20 Kb) 提取方案在 Covaris truPOP ® Buffer中提取的 gDNA(30 μl 全血)的大小分布图。在扫描模式下,96 个样本的处理时间为 6 分钟。

gDNA 片段的窄尺寸分布

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图 4:使用两种不同的格式和密封选项,在 LE220-plus 上剪切后使用片段分析仪对 DNA 进行分析。显示了 8 AFA-TUBE TPX 条和 96 AFA-TUBE 板的 175 bp 和 350 bp 10 µl 的数据。结果显示所有三种配置均具有较高的重现性和准确性。

直接从全血中进行高度可重复的 DNA 片段化

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图 5:图表显示了高度可重复的 DNA 片段化谱(30 μl 全血)和低变异系数。 DNA 片段大小模式介于 1 和 1.3 kb 之间。通过调整 AFA 条件(未显示)可以实现剪切至 NGS 兼容的片段大小分布(150 至 500 bp)。通过调整提取缓冲液条件(例如 Covaris 的 truPOP 缓冲液)可以提取高分子量 DNA (40 kb)。对于 96 AFA-TUBE TPX 板,每列处理时间为 30 秒。