中山市肿瘤研究所季明芳副所长
广东省中山市肿瘤研究所是我国肿瘤早诊早治基地之一,在各种恶性肿瘤的早诊早治、肿瘤登记系统化、肿瘤综合治疗方面业绩突出,承担多项国家科研课题。其完善的肿瘤病例登记系统达到国际领先水平,建立了一个大型的高危人群连续跟踪样本库,为开展前瞻性大规模队列研究打下坚实的基础。日前,测序中国采访了中山市肿瘤研究所季明芳副所长,针对中山市肿瘤研究所的发展历程,样本采集、收录、管理工作的前瞻性和重要性做了详细介绍。
中山市肿瘤人群队列的发展
从1970年开始,中山市便进行恶性肿瘤登记,至今已积攒了40多年的登记资料,得到了各种肿瘤的发病和死亡的详细病例,为进行进一步的研究提供了大量的参考资料。季副所长表示,中山市在发展肿瘤人群队列的同时,也积极开展肿瘤的防治工作,包括肿瘤的早期发现等相关内容。中山市是鼻咽癌的高发地区,所以在八十年代就开始进行了鼻咽癌的早期筛查。从1986年开始,中山市肿瘤研究所就已经开始承担国家层面与鼻咽癌相关的科研项目。从2009年开始,中山市开展人群的鼻咽癌早期筛查的工作,并且开始建立新的标本库。2010年,中山市成为国家卫生部的鼻咽癌的早诊、早治项目示范点,并于2012年又成为国家肝癌早诊、早治的示范点。此后,又进一步对中山市的人群开展了更加丰富的、针对其他癌症的早诊、早治筛查工作。
季副所长强调:“由于早期标本库在保存等技术上的问题,很多标本已经不能使用,所以在新建肿瘤标本库的时候,我们非常注意标本保存的仪器设备以及程序和操作的相关问题。”从2009年至今,其逐渐收集了数万例标本,大大丰富了标本库,其中主要为血液标本。在不断随访的过程中,中山市肿瘤研究所也在继续搜集其他标本。2015年,中山市肿瘤研究所自主新建了冷库,目前这些标本都储存在这一冷库中,为临床人群的实验建立了坚实的基础。
建议有意义的肿瘤人群队列
当前基因产业发展迅速,精准医学也自奥巴马宣布“精准医学计划”后便不再陌生,行业内的公司及企业千帆竞技,涌入精准医学市场。与此同时,季副所长也表示了其担忧,目前很多精准医疗公司宣称进行万人或者十万人的样本调查,实际上只做了人群现阶段样本的搜集,而肿瘤是非常复杂的疾病,单纯地检测一个人群的肿瘤突变频率,对肿瘤的诊治工作实际上意义不大。
中山市从2009年开始建立的数万人群的队列,通过已有的生化检验和影像学等方法确定了高危人群,而且这些人群有一部分在检测过程当中已经逐步地发展成为癌症。例如,2009年建立的鼻咽癌人群队列当中已经发现了60多例鼻咽癌患者;2012年建立的肝癌队列也有80多例新发肝癌。
当前,中山市最常见、最高发的肿瘤为肺癌,其次是肝癌、胃肠道肿瘤和鼻咽癌。当初建立的人群队列到目前已经有几百例发展成其他的癌症,虽然目前还没有这方面的详细总结,但是通过肿瘤登记系统可以得到准确的数据。
另外,我国癌症高发的年龄是50岁以后,人群队列的年龄是从30岁到69岁。随着随访时间的延长,队列人群的年龄不断地增长,更多人群进入到癌症高发的年龄,队列里的人群罹患癌症的则会更多。
癌症早期筛查意义突出
季副所长表示,每个人都有患癌症的几率,随着寿命的延长,研究发现每个人大概有25%的机会患癌症,而癌症检测在早期的时候更加有意义,尤其在高危的人群中。因为除了遗传的因素,生活环境、生活习惯也会影响到获得癌症的几率。
如果能够把在人群队列数据基础上研发的肿瘤早期筛查产品应用于广大人群,进而发现早期的癌症,是具有很大意义的。季副所长表示,其肝癌早期筛查的工作已经进行了五年,总结发现,早筛的成本很高,但是敏感性较差,相对于在门诊当中的筛查率并没有提高太多。这说明需要找更加有敏感度、更加有效的方法。而在影像学和一般检验的早期筛查效率很难再前进的时候,就期望在分子领域有更加准确的方法来提高早期癌症的检出率。
此前,中山市肿瘤研究所与恒特基因基于此方面进行了相关合作。合作基于恒特基因自主研发的PANO-SeqTM技术,以其超高灵敏度、高特异性及稳定可靠等特点,对中山市肿瘤研究所收集的大型高危人群样本库,进行肿瘤游离核酸(ctDNA)检测,期望以此引领ctDNA二代测序技术的肿瘤早期筛查应用。
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