经过长达近2年的随访（这一点是极为难得的），这24名患者在手术治疗之后，有10名一直没复发，剩余14名患者肿瘤卷土重来。液体活检的表现如何呢？在14名复发的患者中，有13名患者血液中出现了2个及以上的基因突变；在10名没有复发的患者中，只有1个患者血液中出现了2个及以上的基因突变。这意味着液体活检在预测早期癌症的复发上灵敏度为93%，特异性为90%，这真是很漂亮的数据了。然而，更让人惊喜的数据还在后面。

来源：奇点网

1. 近日《自然》杂志中，国际大麦基因组测序联盟 （IBSC）将细菌人工染色体的分层鸟枪法测序、纳米通道阵列基因组作图、染色体尺度支架组装和染色体构象捕获结合起来，生成了大麦（Hordeum vulgare L.）的基因组。这是对小麦族基因组中心体周围区域的首次全面、完全有序的组装，结果表明大麦的 7 条染色体每条各分为 3 个部分。作者还对 96 个优异的欧洲春大麦和冬大麦品系的外显子组进行了测序，并研究了它们的遗传多样性，凸显了这一序列对谷类基因组学和育种项目的实用潜力。
2. 一项新研究表明，基因组分析可为卵巢癌提供新的治疗信息。由BC癌症研究所和哥伦比亚大学引领的一项国际研究追踪了100多个卵巢癌的点突变和结构变异，经过分析，确定了7种肿瘤分子亚型。相关研究结果于4月25日在线发表在《Nature Genetics》杂志上。
3. 日前，发表在《科学》杂志上的一项研究中，来自Broad研究所等机构的研究人员利用单细胞RNA测序技术鉴定出了人体内的新型血细胞，共发现了2种新的树突状细胞亚型、2种新的单核细胞亚型。同时，他们还鉴定出了一种新的树突状细胞祖细胞（dendritic cell progenitor）。据悉，这是人类细胞图谱计划的首批重要成果之一。
4. 近日，Nature出版集团旗下期刊Scientific Reports在线发表了来自WeGene、中南大学，德国马普研究所的研究人员取得的最新研究成果。该工作基于来自消费级基因检测的2139名中国男性Y染色体数据，构建了更高精度的中国人父系祖源图谱。这对于理清中华民族的起源、迁徙和融合历史、法医身源鉴定等都有重要意义。
5. 据《自然》发表的一项研究显示，通过分析血液中的特定遗传标记，可以对肺癌的演变进行监测。研究表明，在血液样本中发现的循环肿瘤DNA（ctDNA）与组织亚型和其他变量（包括病情复发）相关。这些发现表明，液体活检或可提供一种非侵入式方法来分析肺癌患者，这也许有助于改进治疗方法，限制肿瘤复发。
6. 美国耶鲁大学医学院的研究人员设计出一种“二聚体开关”来控制拟杆菌中的基因表达，能够研究不同状态下的细菌菌群，并且精确查明参与多种功能的特定基因和通路。这是理解肠道微生物组在健康和疾病中发挥的影响的一个关键的步骤。相关研究结果发表在4月20日的Cell期刊上。
7. 4月21日，复旦大学生命科学学院丁琛研究员课题组与国家蛋白质科学中心（北京）秦钧课题组合作在Nature Communications杂志上发表了题为“A Mouse Tissue Transcription Factor Atlas”的研究论文，该研究揭示了转录因子在小鼠各个不同器官的表达情况，为整个蛋白质组学研究填补了这一领域的空白。该项研究对于理解转录因子调控基因表达以及开展相应的基础和转化医学具有重要的理论指导和应用价值。
8. 利用基因标记技术”CRISPR/CAS9″，来自加州圣地亚哥分校的研究者与来自中国的研究者们能够将突变的杆状光学受体修复，使其功能恢复正常，这一技术成功地使两种不同类型的患有视网膜退行性疾病的小鼠的视力恢复了正常。相关结果发表在最近的《Cell Research》杂志上。
9. 研究人员在4月25日刊登于《细胞通讯》期刊的研究论文中称，他们使用来自161个现在犬种的基因序列汇编了一个狗进化谱系。这个狗家谱提供了新证据显示，狗曾随主人穿越白令海峡，并很可能帮助研究人员鉴别出了能同时导致狗和人生病的基因。
10. 日前，马里兰大学的托马斯·彼得森及其同事开发了一种新的统计分析方法，使用癌症患者的遗传数据来发现致癌突变。与以前关注个别基因突变的研究不同，新方法解决了相关蛋白家族共享的类似突变，可确定数以千计的之前被忽视的（尽管罕见）可能有助于癌症生长的遗传突变。这项研究发表在《 PLOS 计算生物学》杂志上，为研发新药铺平了道路。
    
    

    新发表文章

    【新技术】

    1. High-purity circular RNA isolation method (RPAD) reveals vast collection of intronic circRNAs.Panda AC et al. Nucleic Acids Res. 2017 Apr 21.

    【动物】

    1. Next-Gen Sequencing Analysis and Algorithms for PDX and CDX Models.Khandelwal G et al.Mol Cancer Res. 2017 Apr 25.

    【植物】

    1. Parsing the Regulatory Network between Small RNAs and Target Genes in Ethylene Pathway in Tomato.Wang Y et al.Front Plant Sci. 2017 Apr 11

    2. Identification of MicroRNA Targets of Capsicum spp. Using MiRTrans-a Trans-Omics Approach.Zhang L et al.Front Plant Sci. 2017 Apr 10

    3. Transcriptome profiling of sulfate deprivation responses in two agarophytes Gracilaria changii and Gracilaria salicornia (Rhodophyta).Lee WK et al.Sci Rep. 2017 Apr 24

    【微生物】

    1. Deep Sequencing Analysis of RNAs from Citrus Plants Grown in a Citrus Sudden Death-Affected Area Reveals Diverse Known and Putative Novel Viruses.Matsumura EE et al.Viruses. 2017 Apr 24

    2. Bacterial community dynamics and functional variation during the long-term decomposition of cyanobacterial blooms in-vitro.Shi L et al.Sci Total Environ. 2017 Apr 21

    3. A novel dense granule protein, GRA41, regulates timing of egress and calcium sensitivity in Toxoplasma gondii.LaFavers KA et al.Cell Microbiol. 2017 Apr 24.

    【肿瘤】

    1. Therapeutic Targeting of PTK7 is Cytotoxic in Atypical Teratoid Rhabdoid Tumors.Messerli SM et al.Mol Cancer Res. 2017 Apr 25.

    2. The global expression profiling in esophageal squamous cell carcinoma.Dai F et al.Genomics. 2017 Apr 22.

    【其他】

    1. Human pluripotent stem cells recurrently acquire and expand dominant negative P53 mutations.Merkle FT et al.Nature. 2017 Apr 26.