MicroRNA（miRNA）是一类由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子，是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成。miRNA在基因位置及序列上高度保守；每个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因；miRNA可以通过破坏靶mRNA的稳定性，抑制靶mRNA的翻译来对靶mRNA发挥调控作用。miRNA通过调节基因表达，在植物生长发育、逆境响应等过程中发挥重要调控作用。研究miRNA的产生和功能机制，对于揭示基因表达调控规律、开发改良作物农艺性状的新资源具有重要意义。

AGO蛋白质是一类庞大的蛋白质家族，是组成RISCs复合物的主要成员。AGO蛋白（argonaute proteins）由N末端、PAZ、MID和PIWI4个结构域组成。除了酿酒酵母，AGO蛋白在所有真核生物中均有存在，同时在细菌和古细菌中也有。AGO蛋白是RNA干扰通路中的关键因子，能够从转录、转录后及翻译水平参与基因表达的调控，并在基因组的完整性维持方面发挥着重要作用。

植物中miRNA主要在细胞核中被DCL1、HYL1和SE组成的切割小体（Dicing body）加工而成，随后成熟的miRNA进入细胞质中，再以AGO1为中心的RNA沉默复合体（RISC）对靶基因进行剪切或翻译抑制。有研究表明，HYL1在细胞核和细胞质均存在；在细胞核中，HYL1是DCL1重要的互作蛋白，主要参与miRNA加工过程；在细胞质中，HYL1能够与AGO1和AMP1互作，通过调控AGO1在多聚核糖体上的累积，进而调控miRNA介导的翻译抑制过程。

HEN1蛋白是一类作用于RNA 3’末端的甲基转移酶，其同源物在植物、动物和细菌中均有存在。HEN1蛋白对miRNA和siRNA的甲基化有助于增强小RNA的稳定性。甲基化能够保护miRNA避免3’末端的尿苷化，从而避免3’-5’核酸外切酶介导的降解。HEN1蛋白最开始是作为一个植物花发育相关基因被发现，它在雄蕊和心皮发育过程中发挥着重要的作用。有研究表明HEN1突变株中miRNA的丰度明显减少，说明HEN1对miRNA积累十分重要。

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