Overexpression of CXCR2 predicts poor prognosis in patients with colorectal cancer. Authors: Jingkun Zhao, Baochi Ou, Hao Feng, Puxiongzhi Wang, Shuai Yin, Congcong Zhu, Shenjie Wang, Chun Chen, Minhua Zheng, Yaping Zong Journal: Oncotarget (2017)
Cadherin-12 enhances proliferation in colorectal cancer cells and increases progression by promoting EMT Authors: Junjun Ma, Jingkun Zhao, Jun Lu, Puxiongzhi Wang, Hao Feng, Yaping Zong, Baochi Ou, Minhua Zheng, Aiguo Lu Journal: Tumor Biology (2016): 1–12
The migration and differentiation of hUC-MSCsCXCR4/GFP encapsulated in BDNF/chitosan scaffolds for brain tissue engineering Authors: Chuanjun Huang, Longxiang Zhao, Jun Gu, Dekang Nie, Yinan Chen, Hao Zuo, Wei Huan, Jinlong Shi, Jian Chen, Wei Shi Journal: Biomedical Materials (2016): 035004
Transplantation of RADA16-BDNF peptide scaffold with human umbilical cord mesenchymal stem cells forced with CXCR4 and activated astrocytes for repair of traumatic brain injury Authors: W Shi, CJ Huang, XD Xu, GH Jin, RQ Huang, JF Huang, YN Chen, SQ Ju, Y Wang, YW Shi Journal: Acta Biomaterialia (2016): 247–261
迄今为止,许多生命过程背后的确切机制仍然难以捉摸,因为我们“观察”蛋白质微小部分及其相互作用的方法受到限制。现在,一种新的混合技术利用了电子显微镜、纳米技术、复杂的图像处理和 3D 绘图软件以及标记和测量蛋白质的方法的力量。突破性的方法是从读取 DNA 本身的物理启动开始,揭示我们最微小的运动部件的结构和功能。
转录对于细胞基因的表达至关重要,即“读取”DNA 片段以开始产生所需的蛋白质。其中一个关键角色是 RNA 聚合酶 II(RNAPII),它是一种从起始 DNA 合成信使 RNA 的纳米机器。同样重要的是它的助手 TFIIF,它可以识别 DNA 启动子并向 RNAPII 发出信号,从哪里开始读取一定长度的遗传密码。到目前为止,这对动态二人组相互作用背后的机制仍然难以捉摸,因为太小而无法可视化。
在中国台湾,Wei-hau Chang 博士和他的团队开创了一种混合技术,对这些重要蛋白质复合物的解剖结构和功能产生了深入的认识。他们超越了冷冻电镜和 X 射线晶体学的界限,使用一种新颖的电子显微镜成像技术进行单颗粒分析,然后通过 FRET 分析进行微小测量,以进一步提高其绘图的精度。他们的发现不仅解开了 TFIIF 在 RNAPII 上的位置之谜,而且还揭示了这些是移动部件,发生戏剧性的转变以与 DNA 结合——让我们第一次看到基因转录的物理起始过程。
当他们着手研究由 TFIIF 和 RNAPII 形成的 DNA 读取复合物的结构时,Chang 等人。需要用更明显的标签来标记难以看到的蛋白质,然后可以用它来确定它们的确切位置。他们首先用 Nanogold®(一种单一的金纳米颗粒)标记 TFIIF 蛋白的末端;黄金的电子密度很高,因此在电子显微镜下会显得明亮。该团队利用酵母中的基因表达技术,在 TFIIF 上创建了带有 10 个组氨酸的 TAP 标签,然后该标签与 Nickel-NTA-Nanogold ® (Nanoprobes Inc.)紧密结合,为他们的 EM 工作提供了清晰的标记。
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