含有伯氨基的生物分子的 NHS 酯标记介绍

含有伯氨基的生物分子的 NHS 酯标记介绍

NHS(N-羟基琥珀酰亚胺)酯和其他活化酯(磺基-NHS、磺基四氟苯基 – STP)是适合氨基修饰的反应性化合物。 NHS 是最常见的活化酯类型。

常见的修饰是荧光标记、荧光猝灭剂和其他报告基团。可以使用活化酯连接炔烃和叠氮基,以使生物分子适应点击化学。

尤其常见的是蛋白质和肽的修饰,因为它们几乎总是含有氨基。其他例子是氨基寡核苷酸的修饰、氨基修饰的DNA和含氨基的糖。

NHS 酯与氨基的反应强烈依赖于 pH 值:在低 pH 值下,氨基被质子化,并且不会发生修饰。在高于最佳 pH 值时,NHS 酯的水解速度很快,并且修饰分子的产率会降低。改性的最佳pH值为8.3-8.5。

水是用于溶解 NHS 酯以进行生物分子标记的常用溶剂。如果NHS酯难溶于水溶液,可首先将其溶解在 二甲基亚砜(DMSO)或二甲基甲酰胺(DMF)中,然后添加到pH 8.3-8.5缓冲液中的蛋白质溶液中。请注意,DMF 可以降解为二甲胺,二甲胺具有鱼腥味,并且能够与活化酯发生反应。因此,标记生物分子时,使用不含二甲胺、无鱼腥味的高质量DMF非常重要。

我们建议使用以下通用方案用Lumprobe 生产的NHS 酯标记生物分子:

  1. 使用下面的公式或我们的蛋白质标记计算器计算所需的 NHS 酯量

    NHS_酯_重量 [mg] = 8 × 氨基_化合物_重量 [mg] × NHS_酯_摩尔_重量 [Da] / 氨基_化合物_摩尔_重量 [Da]。

    8是摩尔过量的NHS酯。它是单标记的经验值,适用于许多常见的蛋白质和肽。然而,在某些情况下,使用更少或更多的 NHS 酯可以增加修饰生物分子的产量。它取决于蛋白质结构、标记所用试剂及其溶解度。 Lumiprobe 产品的摩尔重量可以在相应的产品页面上找到。

    例如,要使用 Cy5 NHS 酯(摩尔量 616 道尔顿)标记 3 mg BSA(摩尔量 66500 道尔顿),并获得单标记产物的最大产量,应使用 8 × 3 mg × 616 Da / 66500 Da = 0.22 毫克 Cy5 染料 NHS 酯。

  2. 计算反应混合物的体积。标记反应中的最佳生物分子浓度为1-10 mg/mL。标记可以在任何规模上进行,从纳摩尔到几十克。如果标记少量生物分子,请将反应混合物的体积保持在低水平 (10-20 uL)。

  3. 将 NHS 酯溶解在 1/10 反应体积的水、DMF 或 DMSO 中。不含二甲胺的DMF或水是优选的溶剂。溶解在 DMF 中的 NHS 酯可在 -20°C 下在溶液中保存 1-2 个月。 NHS酯的水溶液配制后应立即使用。

  4. 将生物分子溶解在 9/10 反应体积的 pH 8.3-8.5 缓冲液中。

    0.1 M 碳酸氢钠溶液具有适当的 pH 值。另一种选择是 0.1 M 磷酸盐缓冲液。请注意,pH 值是成功用 NHS 酯标记生物分子的最重要因素。避免使用含有胺的缓冲液(有时可以使用基于 Tris 的缓冲液,但不推荐使用。Tris 含有氨基,但对活化酯的亲和力较低)。

    在进行大规模标记(使用数百毫克 NHS 酯)时,请注意,由于 NHS 酯的水解,混合物会随着时间的推移而酸化。监测 pH 值,或使用浓度更高的缓冲液。

  5. 将 NHS 酯溶液添加到生物分子溶液中,并充分涡旋。在冰上放置过夜,或在室温下放置 1 至 4 小时。

  6. 使用适当的方法纯化缀合物:大分子凝胶过滤是最常见的。色谱法是另一种选择。对于蛋白质和核酸,可以使用乙醇或丙酮沉淀。有机杂质(如 N-羟基琥珀酰亚胺、NHS 酯和水解产生的酸)几乎总是可以通过这些方法轻松分离。

血液中含有什么以及它是在哪里制造的?

血液中含有什么以及它是在哪里制造的?

血液的成分

血液是悬浮或溶解在水中的细胞、蛋白质、离子、糖、信号分子、营养物质和气体的复杂动态混合物。血液也会重新分配热量。血液的成分随着我们的饮食、运动状态、水分、一天中的时间、损伤和病原体的挑战而不断变化。血液制品除了在哺乳动物中发挥重要作用外,还具有重要的离体应用。例如,血清和白蛋白是细胞培养的重要试剂。血液是怎样制造的?血液的成分是什么?血液的这些成分从何而来?

血液中含有什么以及它是在哪里制造的?

血液的成分。血液的一些主要成分的例子。添加抗凝剂并离心后的血液外观如左侧所示。稻草色的血浆位于红细胞上方,红细胞被一层称为血沉棕黄层的白细胞隔开。成分大致按大小顺序排列,范围从细胞到包括水在内的小分子。对于抗体和较小的分子,使用空间填充分子结构。有关组件的进一步说明,请参见下表。图片来源:Cell Guidance Systems 和 Bigstock(脂蛋白和 EPO 图形)。  


血液是由许多不同的器官产生的

当血液在全身流动时,沿途的各种器官和组织都有助于其成分的产生。其中一些组织和器官,例如骨髓,主要专注于产生血液成分,而其他组织和器官,例如肝脏,则具有许多其他重要功能。血液除了携带营养、氧气和免疫系统细胞外,还携带激素、细胞因子和 RNA 等信号分子遍布全身。信号分子可以携带在细胞外囊泡例如外泌体中。这些脂质和蛋白质的小空心球与靶细胞有效融合,释放其生物活性成分。血液还将废物从组织运送到身体的器官,例如过滤和分泌废物的肝脏、肺和肾脏。所有这些成分都有不同的寿命和从血液中去除的机制。下表重点介绍了它们的功能和起源。组件按其尺寸的大致顺序列出。 

血液的主要成分、功能和来源 

成分

功能

来源

气体

新陈代谢所需

空气通过肺部
二氧化碳

新陈代谢的废物

所有细胞和空气都通过肺部

其他分子的组成部分

空气通过肺部
笑气

血管扩张剂

所有细胞

溶剂

水 

血液其他成分的液体载体和体内细胞的水合来源。    

通过消化系统摄入和吸收。 

小分子

盐类

维持渗透压,细胞功能的离子来源。当总体盐含量过高时,大脑会感觉到这一点,使我们感到口渴

通过消化系统摄入和吸收。 
代谢物

细胞产生的废物在血液中运输并主要通过肾脏和肝脏清除。 

所有细胞
糖类

能量之源

通过消化系统摄入和吸收。 
维生素和营养素

细胞功能和新陈代谢所需 

通过消化系统摄入和吸收。皮肤(维生素D)

信号分子

细胞因子和生长因子。  小蛋白质信使分子。请参阅这篇文章了解更多详细信息。   它们是由所有细胞产生的。
荷尔蒙

信使分子可以是蛋白质,例如胰岛素,也可以是化学物质,例如甲状腺素。 激素的例子包括:

从多种来源分泌
雌激素

女性性器官的发育调节月经周期。 

卵巢
睾酮

男性性器官、肌肉组织和面部毛发的发育。 

主要由睾丸产生,但也来自其他来源(例如卵巢)
胰岛素

调节血液浓度。 

胰腺
胰高血糖素

调节血液浓度。 

胰腺
肾素

有助于血压控制。 

肾脏
甲状腺素

三碘甲状腺原氨酸的前体。 

甲状腺
三碘甲状腺原氨酸 

控制新陈代谢率。

肝脏、肾脏及其他
内啡肽

阻止疼痛。 

垂体前叶
抗利尿激素  

刺激肾脏的水潴留。 

由下丘脑制造,由垂体分泌

主要血液蛋白质

白蛋白

血清白蛋白是血浆中的主要蛋白质。白蛋白结合并运输激素、脂肪酸和其他化合物。白蛋白具有缓冲 pH 值、维持渗透压等功能。 

由肝脏制成
抗体 

以数百万种不同形式生产以识别外来蛋白质。 

由 B 细胞在 T 细胞的帮助下产生(见下文)。
纤维蛋白

排列成长链的不溶性蛋白质。促进凝血。 

由凝血酶与纤维蛋白原作用而形成。
纤维蛋白原 

一种糖蛋白复合物,在损伤期间转化为纤维蛋白。 

由肝脏制成 
血红蛋白

血红蛋白与氧气结合,将其从肺部输送到体内的其他组织。血红蛋白还运输血液中约 75% 的二氧化碳以供呼出。血红蛋白包装在红细胞中,以防止其对脉管系统和暴露的组织造成氧化破坏。 

红骨髓

脂质(脂肪)

胆固醇

对于构建细胞壁、制造激素、胆汁酸和维生素 D 非常重要。过量会导致心脏病。可以与蛋白质结合成脂蛋白(见下文)

由肝脏产生,也通过消化系统从食物中吸收
甘油三酯

在两餐之间提供储存的能量来源。可以与蛋白质结合成脂蛋白(见下文)

由食物、脂肪细胞提供,在肝脏中产生。 

脂蛋白

(脂质和蛋白质的复合物)  

乳糜微粒——最大的脂蛋白 

从肠道携带甘油三酯。

食品
极低密度脂蛋白(VLDL)

运输肝脏中产生的甘油三酯。


低密度脂蛋白(LDL)

运输肝脏中产生的胆固醇。这种胆固醇就是低密度脂蛋白胆固醇。它通常被认为是坏胆固醇。

高密度脂蛋白(HDL)

将多余的胆固醇从动脉壁和细胞中清除回肝脏进行回收和处理。一般认为不错。

动脉壁

细胞外囊泡

细胞外囊泡 (EV)

不同大小的小空心球,具有含有蛋白质和 RNA 货物的脂质壁。包括由活细胞产生的外泌体(50-200nm)、微粒(200 nm 至 1 µm)以及由死亡细胞产生的凋亡小体。外泌体提供信使功能,每毫升的含量约为 1×10 12。 

由所有细胞产生。

血小板

血小板 

小的圆盘状碎片有助于在受伤组织中形成凝块。它们是由巨核细胞的细胞质形成的。它们的比例约为每 20 个红细胞 1 个,寿命为 7-10 天。

巨核细胞存在于骨髓和肺中

红细胞

红细胞

约占总血容量的40%。它们的主要作用是提供血红蛋白的包装。

红骨髓

 

白血细胞

白细胞(白细胞)

以每 600-700 个红细胞 1 个白细胞的比例存在。抵抗感染并帮助重塑受损组织。白细胞也称为白细胞

骨髓、胸腺
淋巴细胞

一种白细胞,进一步分为单个细胞类型 

骨髓、胸腺
T细胞。

对抗感染和癌症等疾病。 

胸腺
自然杀伤细胞。

先天免疫系统的一部分通过攻击病毒感染的细胞来对感染做出初步反应。 

骨髓
B细胞。 

适应性免疫细胞产生针对病原体的抗体。 

骨髓
中性粒细胞

最常见的淋巴细胞约占总数的50%。吞噬病原体的吞噬细胞。

骨髓
单核细胞

吞噬病原体的吞噬细胞。从血液转移到发炎组织,在那里分化成巨噬细胞,巨噬细胞可以协调免疫反应和组织重塑。 

骨髓
嗜酸性粒细胞

杀死寄生虫,破坏癌细胞,并参与过敏反应。 

骨髓
嗜碱性粒细胞 

参与过敏反应

骨髓
巨噬细胞

将它们归类为白细胞可能是错误的,因为它们主要不是在血液中发现的。巨噬细胞是吞噬细胞,可以起源于它们所在的组织(组织驻留巨噬细胞),并且在从血液通过毛细血管壁渗入组织后也可以从单核细胞分化。

骨髓和其他组织