蛋白质印迹实验方案

蛋白质印迹实验方案

裂解缓冲液:

为了准备在凝胶上运行的样品,需要裂解细胞和组织以释放感兴趣的蛋白质。这会溶解蛋白质,使它们可以单独迁移通过分离凝胶。我们使用 RIPA 缓冲液 (beyotime P0013B) 来提取全细胞提取物和膜结合蛋白。

蛋白酶和磷酸酶抑制剂:

一旦发生裂解,蛋白水解、去磷酸化和变性就开始。如果样品始终保存在冰上或 4°C 下,并且将适当的抑制剂新鲜添加到裂解缓冲液中,这些事件可以大大减慢。 Pmsf是我们经常使用的蛋白酶抑制剂。

组织裂解液的制备

用干净的工具解剖感兴趣的组织,最好在冰上,并尽可能快地防止蛋白酶降解。均质化前应将 RIPA(含 1mM pmsf)冰冷。

将组织切成小片,对于约 20 mg 的组织,将约 250 μl 裂解缓冲液快速加入管中,用电动匀浆器(或玻璃匀浆器)匀浆直至全裂解。

在微量离心机中于 4°C 下以 10000~14000g 离心 5 分钟。轻轻地从离心机中取出管子并置于冰上,吸出上清液并置于冰上保存的新管中;丢弃颗粒。

蛋白质浓度的测定:

使用 PAGE 凝胶、Bradford 测定、Lowry 测定或 BCA 测定。牛血清白蛋白(BSA)是一种常用的蛋白质标准品。

制备用于加载到凝胶中的样品:

要变性,请使用带有阴离子变性去污剂十二烷基硫酸钠 (SDS) 的上样缓冲液,并将混合物在 95-100°C 下煮沸 5 分钟。

    1. 清洁玻璃并设置电泳系统。

    2. 制备PAGE胶,根据蛋白质的分子量选择不同浓度的分离胶:

蛋白质大小 (kDa) 凝胶百分比(%)
4-40 20
12-45 15
10-70 12
30-100 10
50-200 8
  1. 4%堆积胶,选择预染色的蛋白质Marker Proteins的大小,以帮助区分蛋白质大小和电泳示踪剂。

  2. 上样跑胶,每孔加样量20-40μg蛋白,加样时注意不要溢出到相邻孔中,造成胶戳孔和交叉污染。

  3. 按照电泳方法推荐的说明进行电泳,当溴酚蓝将凝胶耗尽时终止凝胶电泳。

  1. 将蛋白质从凝胶转移到膜上。 (根据trans-blot系统推荐的说明。)

  2. 查看膜中的蛋白质:丽春红。转印后,用丽春红染料染色约2~5min,检查转印是否成功。然后用蒸馏水冲洗掉染料。

  3. 封闭膜一般用5%脱脂牛奶,或3%~5% BSA。 4 ℃摇床振荡封闭过夜,或37 ℃封闭2小时。封闭后TBS洗涤5-10秒。 

  4. 与一抗一起孵育。按照推荐的抗体稀释度,用TBST(或1%~3%脱脂牛奶)稀释抗体。然后将膜装入自封袋和固定层压机中,将抗体溶液添加到自封袋中,并确保膜与足够体积的抗体一起孵育。

  5. 37℃振荡孵育1~3 h(根据抗体效价和亲和力),或4℃过夜孵育,TBST室温摇床上洗3次,每次5~10 min。

  6. 与二抗孵育,同步骤(4),用TBST稀释,37℃振荡孵育1~3 h。

HRP 偶联抗体的化学发光、显影和固定:ECL 是使用的传统试剂盒。

在暗室中,将显影剂和固定剂分别装入塑料托盘中,在离心管中混合两种试剂(A 和 B 的体积)。确保膜表面蛋白与混合物充分接触。 1~2分钟后去除残留物。

红灯处取出胶片,打开胶片夹,将胶片放在胶片上,取下胶片夹,根据信号强度调整曝光时间,记住曝光过度的胶片不适合分析。

曝光完成后,取出胶片,迅速浸入显影液中,终止显影。显影后,应立即将胶片浸入定影液中成透明膜。用自来水清洗除去残留的固定剂后,在室温下干燥。 

抗酸杆菌染色方案

抗酸杆菌染色方案

分枝杆菌细胞壁含有由分枝菌酸组成的蜡状物质。这些是链长最多 90 个碳原子的 ß-羟基羧酸。耐酸牢度的特性与任何特定物种中发现的分枝菌酸的碳链长度有关(Lyon H 1991)。

 

碱性品红与细菌中带负电的基团结合。分枝菌酸(和其他细胞壁脂质)对染料进入和洗脱(用溶剂洗掉)构成障碍,通过在碱性品红浓水溶液中添加亲脂剂和部分加热可以部分克服这一障碍。

 

技术要点: 包括一个控件

 

方法

  1. 将工作溶液放入科普林罐中,并在 58 -60 ℃水浴中预热10 分钟。

  2. 将切片脱蜡,放入水中。

  3. 在水浴中预热的工作溶液中染色 15 分钟。

  4. 将装有载玻片的 COPLIN JAR放入流动的冷自来水中 2 分钟。

  5. 从科普林罐中取出载玻片并用流水清洗 1 分钟。

  6. 在酸性酒精中进行分化,直到载玻片上不再有颜色流出。

  7. 用水短暂清洗以除去酸性酒精

  8. 用亚甲蓝复染 15 至 30 秒。

  9. 水洗、脱水、澄清并封固在 DPX 中。

结果

  • 抗酸杆菌…………………………………………红色

  • 细胞核…………………………………………蓝色

  • 其他组织成分…………………………..蓝色

试剂配方

 

1、染色液:

 

库存溶液 A(稳定 6 个月)

                        LOC 高泡沫(安利)……. 0.6 毫升

                        蒸馏水………………………. 100 毫升

            库存溶液B       

                        碱性品红……………………………….. 1克

                        无水乙醇…………………. 10 毫升

            这两种溶液可以作为储备溶液保存并在使用前混合。

 

2. 工作液(稳定1个月)

                    将 50ml A 与 5ml B 混合。

 

3.酸性醇——3%盐酸溶于95%乙醇

                        无水乙醇……………………. 95ml

                        蒸馏水………………….2毫升

                        浓盐酸…3毫升

            配制酒精溶液,然后加入浓酸。当

            处理浓酸。

 

4. 1%乙酸中的0.25%亚甲蓝

亚甲基蓝……………………0.25克

蒸馏水…………………………..99毫升

乙酸……………………………….. 1 毫升

冷冻保护剂的储存方案

冷冻保护剂的储存方案

以下方案用于长期保存未染色的自由浮动脑切片。将脑切片转移至冷冻保护剂中并储存在-20°C。根据染色目的,选择合适的用于保存脑切片。

 

冷冻保护剂 1(用于光学显微镜)

 

制备 500 ml 冷冻保护剂

  • 蔗糖—————————————- 150克

  • 0.1M PB —————————- 200 毫升

  • 乙二醇——————– 150 毫升

  • 添加更多 0.1M PB 至最终体积 500 ml,并储存于-20 °C。

冷冻保护剂 2(用于电子显微镜和光学显微镜)

 

制备 1000 ml 冷冻保护剂

  • 乙二醇 ——————- 300 毫升

  • 甘油 ————————————– 300 毫升

  • 0.2M PB ————————– 100 毫升

  • 蒸馏水 ——————- 300 毫升

充分混合并储存在-20°C。

 

冷冻保护剂 3(用于免疫荧光)

 

制备 1000 ml 冷冻保护剂

  • 蔗糖—————————————– 300克

  • 聚乙烯吡咯烷酮 (PVP-40) — 10 克

  • 0.1M PB —————————————– 500 毫升

  • 乙二醇——————— 300毫升

将 PVP-40 添加到 0.1M PB。搅拌溶解。缓慢加入蔗糖溶解,然后加入乙二醇并用0.1M PB定容至1000ml。储存于-20°C。

免疫组织化学 (IHC) – 实验方案

免疫组织化学 (IHC) – 实验方案

免疫组织化学是免疫染色在组织学中的重要应用。它需要使用与生物组织中的这些抗原结合的抗体来特异性检测细胞中的抗原。组织样本通过石蜡包埋或福尔马林固定方法固定,并用抗原修复剂进行预处理。预处理对于通过破坏福尔马林诱导的抗原交联来改善抗原的表达至关重要。然后封闭载玻片以减少背景,并可以通过直接标记或间接测定进行染色。

免疫组织化学 (IHC) – 实验方案

脱蜡

  1. 将载玻片在 60°C 孵育 60 分钟。

  2. 在二甲苯中脱蜡 10 分钟,然后再重复一次。

  3. 在 100% 酒精中水合 5 分钟,然后在 95% 酒精中水合 5 分钟,然后在 85% 酒精中水合 5 分钟,然后在 75% 酒精中水合 5 分钟。

  4. 浸入蒸馏水中5分钟

  5. 浸入 TBS(50 mM Tris、100 mM NaCl、pH 7.6)中,放置 5 分钟,然后重复两次。

抗原修复

  1. 将 500-2000 ml 10 mM 柠檬酸盐缓冲液 (pH6.0) 在不锈钢高压锅中煮沸。

  2. 将载玻片放入染色架中,然后放入高压锅中,确保载玻片充分浸入柠檬酸盐缓冲液中。

  3. 3-4 分钟后,当压力指示阀上升时,孵育 1 分钟。

  4. 将载玻片自然冷却至室温。

  5. 浸入蒸馏水中,放置 5 分钟,重复两次。

  6. 将载玻片浸入 TBS 中 5 分钟,然后重复两次。

  7. 在室温下将载玻片浸入 3% H2O2(新鲜甲醇中)15 分钟。

  8. 用蒸馏水清洗两次,每次5分钟。

  9. 用TBS(pH 7.6)洗涤两次,每次5分钟。

一抗染色

  1. 用 TBS 中的 3% BSA 稀释一抗。用稀释的一抗覆盖载玻片上的组织切片(每张载玻片使用 50-150 μl)。

  2. 37℃孵育30分钟或室温60分钟(最佳孵育时间、孵育温度和抗体稀释度应由各个实验室确定)。

  3. 用TBS洗涤两次,每次5分钟。

二抗染色

  1. 与 100-200μl 聚合物增强剂一起孵育 37C 孵育 30 分钟

  2. 用TBS洗涤3次,每次5分钟。

  3. 与 100 200μl 聚合 HRP 一起孵育,并在 37C 下孵育 30 分钟

  4. 用TBS洗涤3次,每次5分钟。

  5. 加入dAb溶液,孵育3-10分钟(反应进度和最佳时间应根据显微镜确定)。

  6. 用蒸馏水清洗2次,每次5分钟。

  7. 如果需要,用苏木精复染切片,用蒸馏水清洗。将玻片浸入 0.1% HCl 乙醇中 1-10 秒,用蒸馏水清洗。

  8. 95%乙醇脱水1分钟,100%乙醇脱水2×3分钟,二甲苯脱水2×3分钟,盖玻片封固剂。

蛋白质印迹 (WB) – 实验方案

蛋白质印迹 (WB) – 实验方案

蛋白质印迹是一种常用的分子生物学技术,用于分析样品中感兴趣的蛋白质。细胞裂解物由细胞培养物裂解产生,并在凝胶电泳 (SDS-PAGE) 中按重量分离。然后这些蛋白质从凝胶转移到膜上,在膜上它们被封闭并用特异性抗体探测以检测感兴趣的蛋白质。借助灵敏且特异的抗体,可以轻松检测小样品中的修饰蛋白质或未修饰蛋白质。

蛋白质印迹 (WB) – 实验方案

协议:

1. 在封闭液(TBST 中的 5% 脱脂牛奶(50mM Tris、100mM NaCl、0.05% Tween-20,pH 7.6)中振荡孵育 1 小时,封闭膜。

注意:对于磷酸化特异性抗体,使用封闭液中的 5% BSA。

2. 在封闭液中以适当的稀释度稀释一抗。

3. 将膜与稀释的一抗在 40°C 下搅拌孵育过夜。

4. 去除抗体溶液。室温下在 TBST(50mM Tris、100mM NaCl、0.05% Tween-20、pH 7.6)中摇动洗涤膜 3 次,每次 5-10 分钟。

注意:将 Tween-20 浓度增加至 0.1% 可降低背景并提高特异性,但会降低灵敏度。

5. 将膜与在封闭液中稀释(根据制造商说明)的二级 AP 或 HRP 缀合物一起在室温下振荡孵育 1 小时。

6. 按照步骤 4 清洗膜。

7. 在进行化学发光反应之前,用 TBS 清洗膜 2-5 分钟。

8. 根据制造商的说明制备和使用化学发光底物(用于 AP 或 HRP)。

9. 立即包裹膜并在 X 射线胶片下曝光 10 秒至 1 小时。暴露时间可能根据抗体和抗原的量而变化。或者放入成像仪中并进行相应调整。

流式细胞分析方案主要步骤以及流式免疫检测

流式细胞分析方案主要步骤以及流式免疫检测

流式细胞分析方案主要分为4个步骤:  

  • 样品制备:应通过机械分离方法或化学解离技术制备单细胞悬液,如采用酶溶液或钙螯合试剂。

  • 封闭:通常采用抗Fc抗体稀释液悬浮细胞,防止一抗非特异性结合。

  • 抗体孵育:流式细胞分析的孵育步骤涉及多种组分,包括一抗、二抗、链霉亲和素和荧光染料。

  • 数据采集:大多数流式细胞仪都配备获取和转化细胞特征信号必需的软件。用户可根据自身实验要求设定具体的软件参数。

适当的对照

除了目标细胞之外,每次进行流式细胞实验还应包含以下对照:

  • 至少一份未染色样品,与试样同时进行每一步的缓冲液孵育,以优化实验的流速和电压。

  • 一份适当的阴性对照样品,与试样基本相同,但用在一抗的宿主种属中生产的同型对照替代试样中的一抗。该对照用于非特异性结合二抗。

  • 如有需要也可准备一份已知表达所有目标抗原的细胞组成的阳性对照,并与试样共同孵育,但仅用单色检测。

流式免疫检测

同其他免疫检测应用一样,流式细胞分析也可通过多种方法利用抗体探测特定的细胞基元。两大常用方法为:直接检测法和间接检测法。

直接检测法

直接检测法是一种一步染色工艺,通过一抗特异性结合目标抗原,可直接结合支持成像或其他结合状态检测的分子。探测位于细胞表面的抗原时,不建议固定细胞,否则可能导致抗体探针无法接触目标抗原。因此,在数据采集结束前保持细胞活力十分重要。如要查找直接检测法的抗体,可采用Antibody Explorer抗体搜索工具,将Search Within(搜索范围)设为“Primary Antibodies Only”(仅限一抗),application(应用)选择“flow cytometry”(流式细胞分析)。

间接检测法

间接检测法先用纯化抗体与目标抗原孵育结合,再用荧光染料标记的二抗(特异性靶向一抗宿主同型)与一抗特异性结合,形成一抗-荧光二抗复合物。采用纯化一抗搭配各种波长(或颜色)的荧光染料标记二抗(特异性针对生产一抗的宿主同型)可提升抗体库的模块化程度。

氨基PEG实验方案

氨基PEG实验方案

不需要偶联剂。当PH值为7-9时,PEG胺能与NHS酯有效反应。

氨基PEG实验方案
(1)将含有小分子的胺缓慢溶解在有机溶剂中,如DMF、CH2Cl2、DMSO、THF或其他溶剂。
(2)根据反应动力学,在连续搅拌下将含NHS的化合物以1:1或2:1当量mmol添加到反应混合物中。
(3)根据底物的性质搅拌反应混合物3-24小时,并通过LC-MS或TLC板监测。
(4)最终产物可以通过常规的有机合成或柱纯化来分离。

氨基PEG实验方案

比例1:1当量
偶联剂可以是EDC、DCC、HATU。 EDC 交联在酸性 (pH 4.5) 条件下很有效。
(1)开瓶前将EDC和羧酸保持至室温。
(2) 将 100mg 每种试剂(约 100μL)溶解在所需量的可与水混溶的无水溶剂(如 DMF 或 DMSO)中,制备羧酸储备溶液。
(3)将适量的EDC和含胺分子加入适量的活化缓冲液中的羧化表面,并在室温下反应15分钟。
(4)加入DTT猝灭EDC。注意:对于易于清洁的表面,可以跳过淬火步骤,并用偶联缓冲液清洗表面,以去除任何残留的 EDC 和 NHS。
(5)将缀合物缓冲液中制备的羧酸混合物添加至活化的表面并在室温下反应2小时。
(6) 加入羟胺或另一种含胺缓冲液以猝灭反应。羟胺水解固体表面上未反应的 NHS 并形成羟基盐。其他猝灭方法包括添加三聚氰胺、赖氨酸、甘氨酸或乙醇胺;然而,这些含伯胺的化合物可以修饰羧基。 (注:新引入的羧基可以通过重复步骤4和5进一步修饰)
(7) 将偶联缓冲液中制备的所需含胺底物添加到活化的表面,并在室温下反应2小时。
(8) 按照步骤7所述猝灭反应。