Nanobind UL library prep kit
简要描述：Nanobind UL library prep kit，产品型号：900-601-01 。超长纳米孔测序。超高分子量DNA提取辅助试剂盒。
详细介绍
产品咨询
| 品牌 | 其他品牌 | 供货周期 | 一个月 |
|---|---|---|---|
| 应用领域 | 医疗卫生,环保,化工,生物产业,综合 |
Nanobind UL library prep kit，产品型号：900-601-01 。
Nanobind UL library prep kit，描述：
高通量和超长读取(100 kb-1+Mb)现在齐头并进，可以成为您实验室的常客与Nanobind超长测序。该方法已被用于生成长的测序数据。我们在2020年1月以2.44 Mb的读取量打破了之前的2.3 Mb记录。几个月后，我们以290万的读取量打破了这一记录。最近，牛津纳米孔以他们自己的4.1 Mb的读取量打破了我们的记录。
最高的读长度和吞吐量组合
与以前的超长测序方法相比，这种新方法的吞吐量提高了10-100倍。在广泛的样本类型中，始终获得1-2+Mb的最长读取，50-100+kb的读取长度N50，以及10-20+Gb的MinION吞吐量和50-100+Gb的PromethION吞吐量。
此方法旨在100+kb和200+kb读取的数据量。虽然该方法可以用于生成超过200 kb的读取长度N50，但超长数据吞吐量实际上可以通过更温和的读取长度N50 (50-100 kb)。秘诀在于保持高毛孔占有率。
该方法
首先，使用适当的Nanobind试剂盒(CBB，植物核或组织)提取UHMW(50 kb1+Mb)DNA。我们开发了全新的UHMW DNA提取方案，从而降低了DNA的粘性，提高了测序吞吐量，甚至延长了读取长度。
每个Nanobind UL库准备套件配有一个UHMW DNA辅助套件，与适当的Nanobind套件一起用于UHMW DNA提取。
然后，将Nanobind UL文库准备试剂盒与Oxford Nanopore超长DNA测序试剂盒(SQK-ULK001)结合使用，制备UHMW DNA进行测序。基于转座酶的方法用于将测序适配器和马达蛋白添加到UHMW DNA中。ONT试剂盒包含所有酶和试剂。我们的工具包包含Nanobind磁盘和缓冲区执行反应清理。与磁性颗粒不同，我们的磁性Nanobind磁盘可以在不剪切的情况下快速纯化兆酶DNA，首先在提取中，然后在文库准备中。
与其他超长测序方法相比，这种新方法不使用快速测序试剂盒(SQK-RAD004)。与Oxford Nanopore合作，对提取、文库准备和测序进行了基础优化，以实现高孔隙占有率，从而大幅提高产量。它与MinION, GridION和PromethION兼容，并对核酸酶冲洗反应良好。
标准的Nanobind超长测序协议生成一个6倍的MinION库或3倍的PromethION库，该库被拆分并按顺序加载到相同的流式细胞上，通过核酸酶冲洗间隔以最大限度地提高吞吐量(每个流式细胞3次加载，每次24小时)。MinION/GridION/PromethION使用相同的协议。
该方案最初是在培养的细胞、细菌、人血和有核血液样本上开发的。从那时起，它已经扩展到动物组织和植物样本。改进读取长度和进一步扩大样本类型的工作正在进行中。
包括:
1.NAF无醇结合缓冲液
2.WAF无酒精洗涤缓冲液
3.EB +洗脱缓冲
4.6x Nanobind磁盘
每个套件可用于运行6个流单元，使用3X库。
还包括与适当的Nanobind试剂盒结合使用的UHMW DNA辅助试剂盒，以执行UHMW DNA提取。每个辅助套件包含:
1.10X 红细胞裂解缓冲液
2. 蛋白酶K
3.核糖核酸酶一
4.CLE3消化缓冲液
5.ULL裂解/结合缓冲液
6.CS消化补充剂
上海金畔生物科技有限公司
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